L'université médiévale se distingue de manière essentielle par un antagonisme caractéristique entre faculté des arts et faculté de théologie, cet antagonisme ayant marqué de façon durable l'histoire de la philosophie, tout comme la conception de la profession même de philosophe. Que devient une telle distinction, et la séparation des corpus d'études qui en découle, à la fin de l'âge scolastique? Cet article se propose de répondre à cette question par une mise au point de la situation à l'Université de Paris, durant les XVe et XVIe siècles.