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Doctoral thesis
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Identification of conserved and non-conserved functional elements using lentivector-mediated transgenesis

ContributorsFriedli, Marc
Defense date2009-06-19
Abstract

Ce travail décrit une contribution à l'annotation de génomes par le développement d'une méthode de criblage "in vivo", servant à idenfifier des éléments enhancers de transcription. La stratégie, basée sur la transgénèse par vecteurs lentiviraux, a été appliquée à une région synténique avec le chromosome 21 humain. Contrairement à d'autres études similaires, celle-ci a été réalisée sans aucun biais pour quelque caractéristique de séquence que ce soit, tel que la conservation de séquence au cours de l'évolution. Ce criblage a permis l'idenfication de 3 enhancers, dont seulement un est significativement conservé. Ce travail apporte la preuve de principe d'une nouvelle approche de criblage "in vivo" à grande échelle, permettant l'idenfication de séquences régulatrices. De plus, il démontre que le seul critère de conservation des séquences au cours de l'évolution, est trop restrictif pour une identification exhaustive des enhancers.

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Keywords
  • Enhancer
  • Séquence conservation
  • Comparative genomics
  • Lentiviral vector
Citation (ISO format)
FRIEDLI, Marc. Identification of conserved and non-conserved functional elements using lentivector-mediated transgenesis. 2009. doi: 10.13097/archive-ouverte/unige:4561
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Technical informations

Creation12/02/2009 9:40:00 AM
First validation12/02/2009 9:40:00 AM
Update time03/14/2023 3:19:13 PM
Status update03/14/2023 3:19:13 PM
Last indexation01/29/2024 6:52:39 PM
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