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Title

Identification of conserved and non-conserved functional elements using lentivector-mediated transgenesis

Author
Directors
Defense Thèse de doctorat : Univ. Genève, 2009 - Sc. 4108 - 2009/06/19
Abstract Ce travail décrit une contribution à l'annotation de génomes par le développement d'une méthode de criblage "in vivo", servant à idenfifier des éléments enhancers de transcription. La stratégie, basée sur la transgénèse par vecteurs lentiviraux, a été appliquée à une région synténique avec le chromosome 21 humain. Contrairement à d'autres études similaires, celle-ci a été réalisée sans aucun biais pour quelque caractéristique de séquence que ce soit, tel que la conservation de séquence au cours de l'évolution. Ce criblage a permis l'idenfication de 3 enhancers, dont seulement un est significativement conservé. Ce travail apporte la preuve de principe d'une nouvelle approche de criblage "in vivo" à grande échelle, permettant l'idenfication de séquences régulatrices. De plus, il démontre que le seul critère de conservation des séquences au cours de l'évolution, est trop restrictif pour une identification exhaustive des enhancers.
Keywords EnhancerSéquence conservationComparative genomicsLentiviral vector
Identifiers
URN: urn:nbn:ch:unige-45610
Full text
Thesis - Intro - public document Free access
Thesis - Part I and II - public document Free access
Appendix - public document Free access
Structures
Research group Pathologie Moléculaire de la Trisomie 21 et le Génome Humain (248)
Citation
(ISO format)
FRIEDLI, Marc. Identification of conserved and non-conserved functional elements using lentivector-mediated transgenesis. Université de Genève. Thèse, 2009. https://archive-ouverte.unige.ch/unige:4561

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Deposited on : 2009-12-02

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