Le Léman draine un bassin versant de près de 8000 km2, soumis à une pression anthropique liée à une large population, à l'agriculture et aux industries. Les contaminants émis par ces différents acteurs peuvent se retrouver dans la colonne d'eau, les sédiments et les organismes du lac. Depuis plus de 40 ans la Commission Internationale pour la Protection des Eaux du Léman, ainsi que les institutions de recherche sises autour du lac, traquent ces contaminations en suivant l'évolution des techniques analytiques. La présente revue s'intéresse particulièrement à l'évolution de la contamination du lac par le mercure, les PCB, les pesticides, les médicaments et certains polluants émergents. Le mercure et les PCB sont les premiers contaminants décelés dans les sédiments dans les années 1970. Ces contaminants sont particulièrement ciblés de par leur propension de bioaccumulation dans les organismes et de bioamplification dans la chaîne trophique, et leur écotoxicité élevée. Si la contamination des poissons par le mercure semble maîtrisée avec des valeurs 10 fois inférieures aux limites légales, les PCB posent encore des problèmes pour les poissons gras tels l'omble chevalier (Salvinus alpinus).