L'utilisation massive et souvent inappropriée des antibiotiques mène à une augmentation de la résistance bactérienne. Dans ce contexte, l'emploi de guides de bonnes pratiques a pour but d'améliorer la pertinence des prescriptions d'antibiotiques. Dans le cadre de cette thèse, nous nous intéressons à l'utilisation de techniques de recherche d'information pour assister et faciliter la création et le maintien des guides de bonnes pratiques dans le domaine des maladies infectieuses. En particulier, nous explorons l'automatisation de la construction de ces guides en proposant une approche interactive basée sur un système de question-réponse avancé, capable d'extraire automatiquement de la littérature biomédicale des recommandations de traitements. L'approche développée génère une base de connaissances cliniques sous une représentation formelle sémantiquement interopérable avec une précision de 53% (une réponse positive sur deux au premier rang). Enfin, le système est évalué par des cliniciens spécialisés en infectiologie.