L'analyse de médicaments produits en milieu hospitalier revêt un grand intérêt du point de vue qualité et sécurité des traitements médicamenteux non seulement pour le patient mais aussi pour les personnes manipulant ces médicaments. Au cours de cette thèse, différentes méthodes d'analyse ayant pour objectif la détermination de composés non-UV absorbants et de substances cytotoxiques contenus dans des formulations produites en milieu hospitalier ont été développées pour le contrôle qualité et le contrôle de'environnement. Plusieurs techniques ont été étudiées: L'électrophorèse capillaire couplée à des systèmes de détection de type UV/Vis ou conductimétrique sans contact avec le capillaire a permis de déterminer plusieurs substances actives contenues dans des formulations produites à l'hôpital. La chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse a été employée pour déterminer la contamination par des cytotoxiques sur différentes surfaces de locaux de production de pharmacies hospitalières.