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Title

Impact de la flexibilité moléculaire sur la prédiction de la lipophilie par des approches de modélisation moléculaire

Author
Directors
Denomination Maitrise universitaire en pharmacie
Defense Maîtrise : Univ. Genève, 2011
Abstract La lipophilie est un paramètre important pour la conception rationnelle de médicament (drug design). Cette propriété est essentielle, par exemple, dans les équations QSAR permettant de décrire les effets pharmacocinétiques et pharmacodynamiques des composés en fonction de leur structure moléculaire, ou dans la prédiction de leur mode de liaison dans les sites actifs de cibles thérapeutiques (amarrage ou docking). La lipophilie est mesurée par le log P, coefficient de partage, qui représente la distribution d’un composé neutre dans un système biphasique de solvants non miscible. Dans le monde pharmaceutique, le système biphasqique de référence est le mélange eau/n-octanol. Les données expérimentales de log Poct disponibles dans la littérature sont négligeables par rapport à l'énorme quantité de composés bioactifs pour lesquels ces données sont nécessaires. C’est pour cette raison que de nombreuses méthodes computationnelles de prédiction de la lipophilie à partir de la structure moléculaire ont été proposées. Dans ce projet une nouvelle procédure in silico pour la prédiction de log Poct basée sur une méthode tridimensionnelle fragmentaire existante (le potentiel moléculaire de lipophilie ou MLP) sera explorée en prenant en compte la flexibilité moléculaire par des simulations de dynamique moléculaire. Le succès et l’exactitude de cette nouvelle méthode seront évalués sur une série de composés originaux dont les log Poct ont été déjà déterminés expérimentalement dans notre laboratoire.
Keywords Conception rationnelle de médicamentsModélisation moléculaireLipophilieDynamique moléculairePotentiel de lipophilie moléculaire
Stable URL https://archive-ouverte.unige.ch/unige:16437
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Deposited on : 2011-06-27

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