L'objectif de cet article est de présenter une vue d'ensemble des méthodes potentiellement utilisables pour l'évaluation de la biodiversité des étangs. Une recherche bibliographique a été réalisée afin d'estimer le nombre de publications et, par conséquent, l'intérêt porté aux objectifs poursuivis par les différentes méthodes d'évaluation, tels que la qualité de l'eau, les fonctions hydrologiques et la biodiversité, et à l'évaluation de la biodiversité de quatre types de milieux aquatiques (étangs, zones humides, eaux courantes, lacs). Des rapports d'études provenant d'agences environnementales et d'instituts de recherche (littérature grise) ont également été pris en considération. Nous nous sommes intéressés autant aux méthodes destinées à la recherche fondamentale qu'à celles destinées aux gestionnaires des sites. Les résultats montrent, que des méthodes consacrées à l'évaluation routinière de la qualité biologique ont été principalement développées pour les eaux courantes, et que les eaux stagnantes n'ont pas bénéficié d'autant d'intérêt. Plus particulièrement les mares et étangs ont été largement ignorés, en dépit de leur contribution significative à la biodiversité régionale. Les méthodes d'évaluation s'intéressent principalement à la qualité de l'eau et aux aspects hydrologiques; à l'inverse elles se préoccupent moins de la biodiversité.