Le Complexe récifal du Jurassique supérieur du Jura méridional interne présente une grande variété de lithologies. Les bioconstructions sont petites, variées et ne forment jamais de barrières récifales. Les Calcaires en plaquettes se développent dans une zone topographiquement basse héritée d'une phase tectonique ancienne. Une analyse structurale, basée sur le dépliage en trois dimensions d'un niveau qui replace les affleurements dans leurs positions relatives originelles, nous apprend que la faille du Vuache provoque un décrochement de plus de 10 kilomètres dans la région du Mont de Musièges et qu'un raccourcissement de 20 kilomètres affecte la région étudiée. Des schémas paléogéographiques sont proposés pour le Kimméridgien supérieur et le Tithonien inférieur de la région genevoise. La plate-forme jurassienne prograde en direction de l'est au cours du Jurassique supérieur. La topographie héritée et les fluctuations du niveau marin influencent la répartition des faciès. Les zones topographiquement basses se comblent graduellement.