Bien que les méningiomes soient des tumeurs intracrâniennes généralement solides et fermes, certaines sont associées à des kystes provoquant une confusion diagnostique avec les gliomes et les métastases. Une IRM préopératoire est plus utile que le scanner pour la planification chirurgicale appropriée. Selon Nauta, il existe quatre types de méningiomes kystiques. Dans le type 1 et 2, la tumeur ainsi que la composante kystique doivent être réséquées alors que dans le type 3 et 4 seule la tumeur est enlevée. Si les kystes intra-tumoraux ne sont pas reséqués, la récidive est hautement probable. La distinction entre le type 2 et 3 n'est pas évidente par l'imagerie IRM et il est parfois impossible de le faire en intra-opératoire. Dans ce cas, une exploration microchirurgicale avec biopsie devient nécessaire.