Doctoral thesis
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Computational identification and analysis of conserved non-coding vertebrate elements

ContributorsDousse, Aline
Defense date2016-02-24
Abstract

Les séquences conservées non-codantes sont des éléments qui ont été préservés sélectivement dans le génome d'espèces de vertébrés à travers des millions d'années d'évolution. Ce travail présente une nouvelle stratégie pour identifier ces éléments grâce à une méthode d'alignement global. Ces éléments conservés non-codants sont stockés dans une base de donnée et accessibles via une interface web. Ces éléments génomiques ont ensuite été analysés en utilisant des méthodes computationnelles. Une partie d'entre eux ont des limites bien définies. Certains interagissent avec certaines protéines impliquées dans l'architecture tridimensionnelle du génome, donnant de nouvelles pistes quant à la fonction de ces éléments.

Keywords
  • Evolution
  • Genomics
  • Conserved
  • Vertebrate
  • Non-coding
  • Comparative
  • Alignments
  • Multiple
  • Conservation
  • Computational
Citation (ISO format)
DOUSSE, Aline. Computational identification and analysis of conserved non-coding vertebrate elements. Doctoral Thesis, 2016. doi: 10.13097/archive-ouverte/unige:82294
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Thesis
accessLevelPublic
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Technical informations

Creation29/03/2016 17:41:00
First validation29/03/2016 17:41:00
Update time15/03/2023 01:14:43
Status update15/03/2023 01:14:42
Last indexation31/10/2024 04:05:01
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