UNIGE document Doctoral Thesis
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Title

The anâtaxis phylogenetic reconstruction algorithm

Author
Sonderegger, Bernhard Pascal
Directors
Defense Thèse de doctorat : Univ. Genève, 2007 - Sc. 3863 - 2007/06/26
Abstract La phylogénétique est une discipline scientifique qui a pour but de reconstruire l'histoire de l'évolution à partir des caractères d'organismes vivants ou de données fossiles. Depuis quelques décennies, l'utilisation de caractères moléculaires dans la phylogénétique est devenue incontournable. D'ailleurs, la phylogénétique prend aujourd'hui un rôle important dans l'analyse bioinformatique de toutes sortes de données moléculaires. Il existe un grand nombre de techniques de reconstruction phylogénétique, mais il reste un problème de complexité. Les méthodes modernes basées sur des modèles d'évolution explicites, nécessitent trop de calcul pour être utilisées sur des grands jeux de données. Cette thèse propose Anâtaxis, une nouvelle méthode de reconstruction phylogénétique rapide et capable d'analyser ces grands jeux de données. Elle a l'avantage de prendre en compte l'homoplasie et l'hétérogénéité des vitesses d'évolution entre les lignées. De plus, elle est capable d'opérer sur des données incomplètes ou incertaines.
Keywords PhylogénétiqueMéthodes
Identifiers
URN: urn:nbn:ch:unige-4969
Note Contient un résumé en français de 11 p.
Full text
Thesis - public document Free access
Structures
Citation
(ISO format)
SONDEREGGER, Bernhard Pascal. The anâtaxis phylogenetic reconstruction algorithm. Université de Genève. Thèse, 2007. https://archive-ouverte.unige.ch/unige:496

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Deposited on : 2008-10-29

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