Nous avons étudié la diversité génétique de trois populations dans le contexte multiethnique complexe du Viêt Nam: les Cham (Austronésiens), les Khmer (Austroasiatiques) et les Nung (Taï-Kadaï). Pour cela, quatre systèmes génétiques indépendants ont été analysés: le système HLA (loci A, B, C, DRB1 et DPB1), la région HVS1 de l'ADN mitochondrial, le chromosome Y (SNPs et STRs) et le système GM. Les profils génétiques de ces populations ont été comparés à d'autres populations de la région sud-est asiatique. Nos résultats montrent que la diversité génétique des populations vietnamiennes est corrélée avec leur localisation géographique. La proximité génétique observée entre Cham et Khmer soutient l'hypothèse d'une diffusion des langues Austronésiennes dans la région, alors que la faible diversité de la population Nung révèle un isolement important. Les résultats, concordants entre 4 systèmes indépendants, confirment que le polymorphisme HLA conserve les principaux signaux de l'histoire démographique humaine à une échelle sub-continentale.