L'anamnèse médicamenteuse est le premier pas vers la réconciliation médicamenteuse. Cette anamnèse consiste en établir un historique médicamenteux des traitements suivis par le patient, dans le but d'établir un traitement efficace et de prévenir les événements indésirables médicamenteux. Tous les médicaments pris récemment par le patient y compris les médicaments homéopathiques et ceux pris en automédication, ainsi que des informations concernant la compliance, la posologie, la forme galénique et le moment de la prise doivent y figurer. Le manque de structuration dans l'obtention de ces informations peut conduire à un recueil erroné des antécédents médicamenteux, occulter l'existence d'événements iatrogènes antérieurs ou provoquer l'interruption inappropriée d'un traitement, par exemple. Pour 67-75% des patients au moins, une erreur est détectée dans l'anamnèse médicamenteuse effectuée au moment de l'hospitalisation.