L'objectif de ce travail de thèse est d'étudier le potentiel de la stimulation magnétique transcrânienne (TMS) et de ses effets à court terme sur la perception des émotions. La modulation au niveau comportemental de la perception des émotions est étudiée à travers deux travaux indépendants portant sur la perception des émotions dans les expressions faciales ou la détection des émotions dans les mots. Dans les deux cas, les cibles et le moment pour l'application de la TMS ont été guidés par des résultats d'électrophysiologie. La perturbation de la pré-SMA conduit à la diminution de la reconnaissance de l'expression faciale de joie alors que la perturbation de la jonction temporopariétale gauche ou droite entraîne le ralentissement de la détection des mots émotionnels en particulier dans le champ visuel gauche. Ces résultats confirment une bonne correspondance entre les observations faites en électrophysiologie et les effets dus à la perturbation par TMS.