Environmental and epigenetic mechanisms regulating a COPIA LTR retrotransposon during Heat Stress in Arabidopsis thaliana

Gaubert, Hervé

doi:10.13097/archive-ouverte/unige:32363

Doctoral thesis

English

Environmental and epigenetic mechanisms regulating a COPIA LTR retrotransposon during Heat Stress in Arabidopsis thaliana

Contributors

Gaubert, Hervé

Directors

Fitzpatrick, Thérésa Bridget; Paszkowski, Jerzy

Defense date

2013-10-23

Abstract

Les rétrotransposons représentent généralement une vaste portion des génomes eucaryotes mais sont normalement étroitement contrôlés par les mécanismes de régulation épigénétique de l'organisme hôte. Cependant, ceux-ci restent encore assez mal connus. Ce travail de thèse rapporte les résultats obtenus par l'étude, dans la plante modèle Arabidopsis thaliana, d'un rétrotransposon particulier appelé ONSEN. Chez les plantes exposées à une température de 37°C, ONSEN présente une forte activité transcriptionnelle et la synthèse d'ADN extra-chromosomal est détectée. De plus, de nouvelles copies de ONSEN sont visibles spécifiquement chez les descendants de mutants dont la «RdDM pathway» - la voie de méthylation de l'ADN dirigée par les petits ARNs - est non-fonctionnelle. Ce système a permis d'étudier spécifiquement la régulation de ce rétrotransposon chez Arabidopsis grâce à la combinaison de mutants épigénétiques et du suivi de l'évolution de différentes marques épigénétiques durant l'exposition des plantes aux hautes températures ainsi que de leurs descendants. Le potentiel évolutif de ces éléments mobiles a aussi été abordé.

Keywords

Epigenetics
Transposable elements
RdDM pathway

UNIGE affiliation entities

Faculté des sciences / Section de biologie / Département des sciences végétales

Citation (ISO format)

GAUBERT, Hervé. Environmental and epigenetic mechanisms regulating a COPIA LTR retrotransposon during Heat Stress in Arabidopsis thaliana. Doctoral Thesis, 2013. doi: 10.13097/archive-ouverte/unige:32363

Thesis

Identifiers

PID : unige:32363
DOI : 10.13097/archive-ouverte/unige:32363
URN : urn:nbn:ch:unige-323638
Thesis number : Sc. 4614

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05/12/2013 12:57:00

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Environmental and epigenetic mechanisms regulating a COPIA LTR retrotransposon during Heat Stress in Arabidopsis thaliana

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