Les protéines sont constituées d'acides aminés assemblés entre eux par des liaisons peptidiques. Elles se trouvent en très grand nombre dans l'organisme et remplissent des fonctions très diversifiées dans la plupart des processus biologiques [1]. Etant donné ce lien direct avec les fonctions de l'organisme, les protéines sont de très bons biomarqueurs. Un biomarqueur est « une caractéristique qui est objectivement mesurée et évaluée comme indicateur des processus biologiques normaux, des processus pathogènes, ou des réponses pharmacologiques à une intervention thérapeutique » [2] . Ainsi, les protéines permettent de caractériser un processus, afin de déterminer si la fonction est correcte ou non. L'analyse et la découverte de biomarqueurs permettent donc d'indiquer s'il y a un dysfonctionnement et donc de diagnostiquer une maladie, de suivre l'évolution d'un traitement ou d'une maladie, ou encore de suivre l'action bénéfique ou non d'une molécule [2].