Cette thèse se concentre sur l'histoire du peuplement de l'Asie orientale par les humains anatomiquement modernes (Homo sapiens), et plus particulièrement sur les routes possibles de migrations qu'ils auraient empruntées, suite à leur sortie d'Afrique, pour peupler l'Asie. Nous avons analysé des données de fréquences géniques de cinq gènes du système HLA dans 84 populations de différentes régions géographiques et parlant des langues de diverses familles linguistiques d'Asie orientale. Nos analyses statistiques et simulations informatiques nous ont conduit à suggérer un nouveau modèle de peuplement, le « modèle du chevauchement », proposant l'existence de deux routes de migrations longeant d'une part le sud et d'autre part le nord du plateau tibétain depuis l'Asie occidentale, et d'échanges génétiques intervenus ultérieurement, en Asie orientale, entre les populations issues de ces deux migrations. Nos résultats révèlent aussi une histoire complexe de diversification et d'expansion des familles linguistiques est-asiatiques, et aboutissent à une estimation cohérente des coefficients de sélection de trois gènes HLA.