L'obésité représente l'une des principales préoccupations en matière de santé publique. Il a été démontré que l'obésité provoque la délibération de cytokines pro-inflammatoires engendrant des complications métaboliques. Dans cette optique, nous avons investigué l'impact de la perte du facteur de transcription Signal Transducer and Activator of Transcription 6 (STAT6), principal médiateur des cytokines anti-inflammatoires IL-4 et IL-13, sur le métabolisme cellulaire. Ce travail se focalise sur l'analyse du protéome du tissu adipeux et du foie chez des souris knock-out (KO) pour la protéine STAT6. Plusieurs stratégies analytiques ont été développées basées sur la spectrométrie de masse en tandem (MS/MS) couplée à la chromatographie liquide bidimensionnelle (2D-LC). Nous avons ainsi montré que la perturbation de la signalisation de STAT6 dans le foie et le tissu adipeux induit une modification de l'expression de nombreuses protéines. Ces dernières sont impliquées dans le métabolisme des lipides, dans la glycolyse et dans le stress oxydatif.