Le maintien de la méthylation des cytosines situées dans un contexte CG (mCG) joue un rôle essentiel dans la régulation épigénétique de la transcription chez les plantes et les mammifères, via la structure de la chromatine. Cependant, la transmission des mCG au cours des générations a été étudiée au niveau de quelques loci seulement. Dans ce travail de thèse, les liens fonctionnels entre la transmission trans-générationnelle de la méthylation de l'ADN et les variations phénotypiques ont été analysés en utilisant d'une part des générations successives d'un mutant d'Arabidopsis thaliana affecté dans la maintenance des mCG, le mutant met1-3, et d'autre part une population de lignées recombinantes (appelées epiRILs pour epigenetic recombinant inbred lines) possédant des chromosomes mosaïques, constitués de segments sauvages et de segments appauvris en mCG.