Les foraminifères du genre Elphidium sont parmi les plus abondants en milieux marins côtiers à travers le monde. Malgré leur importance écologique et géologique, la taxonomie classique des membres de la famille des Elphidiidae et de leurs proches parents est souvent ambigüe. Afin de clarifier cette situation et pour mieux définir les différents niveaux taxonomiques dans ce groupe de foraminifères, des analyses moléculaires et phylogénétiques ont été menées sur plusieurs espèces morphologiques du groupe. Un autre aspect intéressant du genre Elphidium est sa capacité à séquestrer des chloroplastes venant d'algues qu'il mangent et digère partiellement. Pendant ce processus, appelé kleptoplastidie, les chloroplastes acquis par le foraminifère restent fonctionnels pendant plusieurs mois, contribuant ainsi à la nutrition de la cellule au travers de la photosynthèse. Les différentes analyses moléculaires décrites dans le présent manuscrit ont permis d'explorer et de mieux comprendre ce processus fascinant et son interprétation dans un contexte évolutionniste.