Cette thèse est consacrée à l'analyse quantitative des inégalités de genre en début de carrière académique en Suisse: devenir assistant, réaliser un doctorat puis les premières années qui suivent son obtention. Dans cette étude, nous mettons notamment en évidence la variation de l'intensité des inégalités en fonction des contextes et des marchés du travail ainsi que les différentes formes qu'elles peuvent prendre. Nous étudions ces inégalités à l'aide des méthodes d'analyses de séquences basées sur le calcul de distances. Nous présentons dans un cadre commun les différentes méthodes développées de manière éparse à ce jour et nous les comparons à l'aide de simulations. Diverses méthodes d'analyses exploratoires de ces distances sont présentées. Un nouveau cadre méthodologique est développé afin de mesurer et d'attester de la significativité de la relation entre séquences et contextes. Ces dernières méthodes sont utilisées pour analyser les différences hommes-femmes tout au long de leur trajectoire.