Ce travail de doctorat s'intéresse à l'élaboration d'un système d'aide à la décision clinique destiné aux pharmaciens cliniciens. Ses objectifs sont l'amélioration de la couverture des pharmaciens cliniciens dans les hôpitaux universitaires ; la réduction du phénomène de fatigue aux alertes (particulièrement lorsque des alertes sont adressées aux médecins). En plus de décrire l'élaboration d'un tel système et son application en médecine interne-pour le ciblage d'une sélection de situations à risque d'iatrogénie-pour la prévention d'évènements indésirables médicamenteux durant la première vague de COVID-19, cette thèse propose des modèles de conception de bases de connaissances susceptibles d'alimenter un tel outil. Nous avons observé qu'un tel système était pertinent pour détecter automatiquement des problèmes reliés à la pharmacothérapie avec des performances satisfaisantes. Une collaboration étroite avec des médecins spécialistes, permet d'identifier ces situations de manière objective, en tenant compte de critères de pertinence et criticité.