SmAu₆ appartient au groupe d'espace P 4₂/ncm (D¹₄⁶h) avec a = 10,39 Å, c = 9,79 Å et Z = 8. Après correction d'absorption, la structure a été déterminée par la méthode d'addition symbolique et affinée tridimensionnellement conduisant à R = 0,15. Elle est constituée par des polyèdres de 15 atomes d'or, centrés par un atome de samarium. Cette structure est géométriquement reliée avec la structure du α-Mn.