Le thème 4 aborde la place du Jura durant la Protohistoire, par le biais des démarches typologiques, des habitats et de l'histoire du peuplement et des peuples. On prend du recul tout d'abord, en s'interrogeant sur le rôle de barrière ou de trait d'union de cet "isthme" au centre de l'Europe, à l'aide de quelques rappels empruntés au Néolithique. A une focale large, fondée sur l'histoire des recherches, répond une prise de distance, chronologique celle-ci, permettant de retracer quelques jalons en termes culturels et de peuplements. On suit, du début de l'âge du Bronze à la fin du Second âge du Fer le développement de cultures qui se succèdent, aux contours variant sous l'effet de dynamiques régionales et d'apports extérieurs. On se concentre sur quelques aspects des apports nouveaux des recherches effectuées au cours des dernières décennies : l'irruption des habitats grâce à l'archéologie préventive, les données extraordinaires (environnementales notamment) issues des palafittes, dont la fouille renouvelle radicalement notre appréhension du mode de vie des sociétés protohistoriques. Quelques spécificités jurassiennes sont évoquées (habitats de hauteur, occupations en grotte, dépôts, rôle fondamental du sel, occupation du sol), de l'âge du Bronze à la fin de l'âge du Fer avec l'apparition, de part et d'autre du Jura, des premières villes dont les noms ainsi que ceux de différents peuples celtiques, vont apparaître à l'histoire.