L'abaissement artificiel, d'environ 3m, du niveau des Trois-Lacs (lacs de Neuchâtel, de Morat et de Bienne) à la fin du XIXe siècle, a induit la modification du profil d'équilibre des bassins lacustres et a entraîné une importante érosion des rives. Suite à ces grands travaux, de nombreux sites littoraux préhistoriques sont découverts, jusqu'au début du XXe siècle. En 1994, un programme de prospection archéologique extensif par carottage est entrepris sur la rive sud du lac de Neuchâtel et sur tout le pourtour du lac de Morat. Son objectif principal est de délimiter et répertorier les sites littoraux. En outre, la prospection extensive a permis de reconstituer partiellement l'histoire des sites après leur abandon. A partir de l'étude de l'implantation de quelques sites, nous proposons des hypothèses de reconstitution de l'habitat et des phénomènes d'érosion qui les ont touchés. Ainsi, la position de certains vestiges, actuellement conservés, permet de reconstituer la partie manquante des villages et d'estimer le niveau moyen du lac au moment de l'abandon.