Les progrès de la connaissance du système immunitaire inné et des techniques d'analyse du génome humain ont permis d'identifier des facteurs qui rendent certains individus susceptibles aux agents infectieux. C'est ainsi que l'on comprend depuis quelques années pourquoi le virus de l'herpès simplex I peut causer des encéphalites dévastatrices chez des enfants dont l'immunité est incapable de détecter la primo-infection. De plus en plus de patients subissent des traitements immunosuppresseurs dans le domaine de l'oncologie, des greffes d'organes ou de l'immunologie. Chez ces patients, certaines infections opportunistes, comme l'aspergillose pulmonaire invasive, sont clairement associées à des polymorphismes génétiques. L'immunosuppression médicale représente un modèle possible d'infectiologie personnalisée, où les infections pourraient être prévenues par des prophylaxies individualisées, basées sur des tests génétiques.