La quantité d'informations obtenue lors de l'étude de génomes augmente de façon constante. La complexité des processus de séquençage conduit à des données imparfaites avec un niveau élevé de bruit. Celles-ci nécessitent une variété de méthodes pour donner une interprétation biologique à leur contenu. Comme certains résultats reflètent mieux la réalité que d'autres, des stratégies pour juger de la qualité des données et des performances des méthodes informatiques sont nécessaires pour guider les choix expérimentaux. Ces évaluations doivent être systématiques et reproductibles. J'explore ici deux aspects liés à l'évaluation de processus informatiques dédiés à la recherche biologique, ainsi que de leurs résultats. Ils sont abordés au travers de deux ressources bio-informatiques distinctes dédiées à l'évaluation des performances (benchmark). i) La plate-forme LEMMI fournit une évaluation continue des outils de classification taxonomique. ii) Le logiciel BUSCO utilise des gènes conservés universellement pour évaluer le niveau de complétion de séquences génomiques.