Cet article étudie les inégalités hommes/femmes pendant la transition du Master à la carrière académique en Suisse. Adoptant une perspective comparative, il se centre sur la variation des inégalités entre les disciplines et les met en lien avec les variations dans les perspectives de carrières en dehors du monde académique. Il en ressort que les inégalités sont particulièrement fortes dans les disciplines où la carrière académique figure parmi les premiers choix, alors que les femmes semblent « favorisées » dans les disciplines où les alternatives sont plus avantageuses. Cette étude démontre la nécessité de situer la carrière académique dans des marchés du travail par ailleurs hiérarchisés et inégalitaires. Elle illustre également l'importance de dépasser les constats globaux sur les inégalités pour s'intéresser aux contextes dans lesquels elles s'expriment.