MOLEKEL est un logiciel d'infographie moléculaire qui a été développé pour visualiser interactivement différents modèles de structures et de propriétés moléculaires. Leur représentation graphique est construite à partir des résultats numériques obtenus par des programmes externes de chimie physique pour lesquels des interfaces ont été implémentées. Les caractéristiques essentielles de ce logiciel résident dans sa grande convivialité, dans la haute qualité graphique des images qu'il permet d'obtenir et dans sa flexibilité en vue de traiter des problèmes chimiques très variés. Deux applications illustrent les possibilités de MOLEKEL: une étude de la distribution de densité de spin dans le biradical bis-nitroxide 1,3,5,7-tétraméthyl-2,6-diazaadamantane N,N'-dioxyl et une modélisation de l'attaque électrophile sur le complexe organométallique ([nu]⁵-C₅H₅)Ru(CO)(PPh₃)(H).