Characterization of the potential effectors of the Flavescence Dorée phytoplasma

Diplôme Master Characterization of the potential effectors of the Flavescence Dorée phytoplasma eng 2024-09-02 2024-08-27 author Pillard-Tapia Laura Lisa 926692 director Debonneville Christophe director Schumpp Olivier director Ulm Roman 0000-0001-8014-7392 732804 Département des sciences végétales (BIVEG) 56 Flavescence Dorée (FD) is an epidemic disease impacting grapevines, associated with Flavescence Dorée phytoplasma (FDp), a small wall-less bacteria living in and feeding from the plant phloem. In the vineyards, FD is mainly transmitted by a leafhopper called Scaphoideus titanus which also feeds on plant phloem. The recent sequencing of the complete genome of FDp strain CH confirmed the presence of cellular mechanisms associated to phytoplasmas and unraveled a list of potential effectors, with the majority annotated as hypothetical proteins. Effectors are proteins secreted by pathogens for the purpose of targeting plant physiology processes or to disrupt plant immune mechanisms, to allow colonization and optimal fitness of the pathogen. They are key proteins to understand the molecular mechanisms in pathogen-host interaction, and therefore how or which molecular elements make grapevine susceptible to FDp. The present work aims to start characterizing FDp effector candidates. Transcriptional profiles of the latter were analyzed in plant and insect hosts. One putative effector gene revealed to be more expressed in grapevine than insect vectors. It was therefore selected for parameters study of in vivo expression in Escherichia coli and for other cloning constructions, in preparation of future experiments. La Flavescence Dorée (FD) est une maladie épidémique de la vigne, associé au phytoplasme de la Flavescence Dorée (FDp), une petite bactérie sans paroi vivant dans le phloème végétal et s'en nourrissant. Dans les vignobles, la FD est principalement transmise par une cicadelle nommée Scaphoideus titanus qui se nourrit également du phloème végétal. Le séquençage récent du génome complet dU FDp, souche CH, a confirmé la présence de mécanismes cellulaires associés au phytoplasmes et a permis de dresser une liste de potentiels effecteurs, pour la plupart annotés comme protéines hypothétiques. Les effecteurs sont des protéines sécrétées par les pathogènes dans le but de cibler les mécanismes physiologiques de la plante ou d’en perturber les mécanismes immunitaires, pour permettre la colonisation et le développement optimale du pathogène. Ce sont des protéines clés pour comprendre les mécanismes moléculaires de l'interaction pathogène-hôte, et par conséquent, quels éléments et procédés moléculaires sont à l’origine de la sensibilité de la vigne face au FDp. Le présent travail vise à commencer la caractérisation des candidats effecteurs de la FDp. Les profils transcriptionnels de ces derniers ont été analysés chez les hôtes végétaux et insectes. Le gène d’un effecteur putatif s'est révélé plus exprimé dans la vigne que dans les insectes vecteurs. Il a donc été sélectionné pour l'étude des paramètres d'expression in vivo dans Escherichia coli et pour d'autres constructions de clonage, en préparation de futures expériences. Groupe de Virologie, Bactériologie et Phytoplasmologie (Agroscope Changins) Flavescence Doree Phytoplasma Effector Characterization RT-qPCR Protein expression Cloning Dewey 580 Master de Biologie orientation Molecular Plant Science (MPS) 45 Département des sciences végétales 163 false b005cb95-8124-468d-8353-9ee9c11d4787 Master thesis Restricted MasterThesis_LauraPillard_2024.pdf 3536916 application/pdf e0a8a94ee70b29048890ec91c177bbca4254ee6177506cea51153ecc6f1220a0 Vignette Public logo agroscope.png 8215 image/png restrictedAccess Faculté des sciences / Section de biologie / Département des sciences végétales

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