Identification of genes under divergent positive selection: the genes that make a dolphin rather than a cow

Diplôme Master Identification of genes under divergent positive selection: the genes that make a dolphin rather than a cow eng 2018 author Adam Céline 727450 director Montoya Burgos Juan Ignacio 47049 Ce travail porte sur l'identification de gènes sous sélection positive divergente par la comparaison de paires de séquences de gènes homologues qu'implémente la méthode PSGfinder (Tuberosa and Montoya-Burgos 2017). J'ai tout d'abord étudié la sélection positive chez les cétacés, représentés par le grand dauphin. En comparant les gènes du dauphin avec notamment ceux de la vache, j'ai identifié des gènes sous sélection positive divergente, exclusifs ou non à la branche du dauphin. Par la constitution de différents jeux de données, j'ai également comparé mes résultats avec ceux d'études qui utilisaient des tests de Codeml (Yang 2007). J'ai ensuite comparé PSGfinder avec des tests de Codeml par l'analyse de 18 gènes provenant de neuf études différentes. Sur ces gènes identifiés sous sélection positive dans des lignées de mammifères par l'utilisation de tests de Codeml, j'ai répété ces tests, et construit des paires de séquences que j'ai ensuite analysé avec PSGfinder. PSGfinder Codeml Sélection positive Sélection naturelle Cétacés Mammifères Gènes orthologues Dewey 590 Biologie option Biodiversité et Systématiques 44 Département de génétique et évolution 162 false 827 Groupe Montoya fbaf6864-d60f-402b-95de-71851407430e Master thesis Restricted MEMOIRE_Adam_Celine_final.pdf 6596343 application/pdf restrictedAccess Faculté des sciences / Section de biologie / Département de génétique et évolution

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Identification of genes under divergent positive selection: the genes that make a dolphin rather than a cow				2018	87	5

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Adam, Céline