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Master
French

Recherche de nouveaux modulateurs de l'activité Toll-like 4 par criblage virtuel

Master program titleTravail personnel de recherche, Master en Pharmacie
Defense date2014
Abstract

Ce travail de Master a pour objectif principal la recherche de nouveaux modulateurs de l'activité du récepteur TLR4. Celui-ci compléxé au co-récepteur MD-2 se trouve à la surface des cellules dendritiques qui en présence du LPS déclenche une réaction immunologique. Les composés recherchés sont des inhibiteurs qui, selon des études computationnelles, sont capables d'inhiber le MD-2 afin d'empêcher la dimérisation du complexe TLR4-MD-2. En ce faisant, les cascades chimiques sous-jacentes entraînées par la liaison du LPS au MD-2 ne sont pas déclenchées et l'état de choc septique est ainsi évité. Pour ce faire, un criblage virtuel de deux librairies moléculaires (log P 1000 et SPECS) a été réalisé. Un traitement de ces bases de données a été fait à l'aide du programme moléculaire MOE. Log P 1000 possède des composés diversifiés dont le poids moléculaire est inférieur à 150 et dont la charge globale est nulle. La base de données SPECS présente une taille plus grande que celle de log P 1000, ce qui a entrainé une recherche de similarité «clustering » et de diversité « diverse subset » moléculaires afin de diminuer le nombre de composés pour le criblage. Deux criblages basés sur le ligand (LBVS) et sur la cible (SBVS) ont été réalisés grâce au programme FLAP après la préparation des bases de données. Le LBVS a été réalisé à l'aide d'inhibiteurs déjà découverts et relevés dans la littérature. Quant au SBVS, le choix de la cible a été le co-récepteur MD-2 humain, dont le code PDB est 2E56 et dont la résolution est de 2.00 Å. Ces criblages ont permis de déterminer les composés à amarrer dans la cible MD-2 par amarrage moléculaire. Cette démarche a conduit à la découverte de 3 composés potentiellement inhibiteurs du complexe TLR4-MD-2.

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Research group
Citation (ISO format)
FREITAS GAGO, Adelina Marta. Recherche de nouveaux modulateurs de l’activité Toll-like 4 par criblage virtuel. 2014.
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Master thesis
accessLevelRestricted
Identifiers
  • PID : unige:45106
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Technical informations

Creation01/13/2015 11:06:00 AM
First validation01/13/2015 11:06:00 AM
Update time03/14/2023 10:40:03 PM
Status update03/14/2023 10:40:03 PM
Last indexation01/29/2024 8:20:22 PM
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