L'axe principal de ce travail a consisté à analyser la diversité nucléotidique des gènes HLA de classes I et II dans une centaine de populations humaines réparties à l'échelle mondiale. Ces gènes sont les plus variables actuellement décrits chez l'Homme, et se sont révélés très informatifs pour étudier l'histoire du peuplement humain. Nos résultats moléculaires apportent une description beaucoup plus fine du polymorphisme de ce système génétique, notamment à une échelle régionale, que les approches envisagées jusqu'à aujourd'hui se limitant aux distributions de fréquences alléliques dans les populations. De plus, tenir compte des différences nucléotidiques entre allèles permet de mieux comprendre l'implication des mécanismes évolutifs (sélection et conversion génique) proposés comme les principaux moteurs de génération et de maintien du polymorphisme. Nous avons notamment mis en évidence de potentielles traces anciennes de sélection sur les allèles du gène HLA-DPB1, un locus supposé évoluer de manière neutre selon la littérature scientifique.