Les microfaunes des plates-formes bioclastiques échinodermiques, très méconnues, sont illustrées par l'étude du Bajocien du Jura méridional, de Bourgogne et des Chaînes subalpines. Les faciès essentiellement calcaires (travail en section), font l'objet d'un inventaire exhaustif de la microfaune qui, est regroupée en 3 associations (AF1-AF3). AF1 (spicules, foraminifères monocristallins, pelagos, etc.) est abondant principalement dans les boues à madréporaires, AF2 (foraminifères porcelanés, péloïdes, petits agglutinés, etc.) dans les alternances marno-calcaires, et AF3 dans les faciès bioclastiques (crinoïdes, bryozoaires, fragments coquillés, etc.). Leur évolution le long des coupes permet de proposer une interprétation séquentielle (6 séquences de dépôt) et un modèle paléoécologique nouveau. La sédimentation oscille entre 2 pôles principaux. 1) Episodes à polypiers et calcaires oolithiques correspondent à des périodes à climat chaud et aride (eaux chaudes, claires, oligo-mésotrophiques). 2) Calcaires bioclastiques à entroques correspondent à des périodes à climat plus humide (eaux à tendance eutrophiques).