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High-throughput phylogenomics : from vertebrate conserved non-coding sequences to viral genomics

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Defense Thèse de doctorat : Univ. Genève, 2011 - Sc. 4315 - 2011/05/17
Abstract L’abondance de données de séquence a permis d’aborder des problèmes biologiques au niveau du génome entier (par opposition, par exemple, à l’étude d’une seule famille de gènes). De nouvelles méthodes phylogénétiques, de même que la puissance croissante des ordinateurs, ont rendu possible l’utilisation de l’information à l’échelle génomique pour construire des phylogénies (qui peuvent à leur tour être utilisées dans l’étude des génomes), donnant naissance à la phylogénomique. Mais l’abondance même des données pose aussi des défis techniques: les procédés d’analyse doivent être entièrement automatisés, les outils logiciels doivent être capables de traiter des ensembles de données plus grands que jamais, et les temps de calcul doivent rester raisonnables. En d’autres termes, le présent travail aborde le problème de la phylogénomique à haut débit.
Stable URL http://archive-ouverte.unige.ch/unige:16082
Full text
Thesis (5.7 MB) - document accessible for UNIGE members only Limited access to UNIGE
Identifiers
URN: urn:nbn:ch:unige-160824
Structures
Research group Swiss Institute of Bioinformatics

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Deposited on : 2011-06-08

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