Ce travail traite de la géochimie des pigments chlorophylliens dans un lac eutrophe. La première partie est consacrée à la recherche et à la caractérisation par diverses méthodes spectroscopiques de nouveaux pigments chlorophylliens tels que la chlorophyllone et les chlorine stéryl esters. Un certain nombre d'hypothèses géochimiques et paléontologiques sont proposées et discutées. La seconde partie aborde les aspects théoriques et pratiques de la spectrométrie de masse tandem avec un système ion trap couplé à une source électrospray, pour l'analyse de chlorines d'origine naturelle. Des schémas de fragmentation ont été établis et des conclusions géochimiques tirées.